本所原隸屬北斗鎮公所戶籍課，行政院於民國五十八年五月十五日臺(五八)內字第三八九九號令頒「戡亂時期臺灣地區戶政改進辦法」，自民國五十八年七月一日起至六十二年三月十一日止試辦戶警合一，將公所戶籍課撤銷，另設北斗鎮戶政事務所，置主任一人由鎮長兼任，副主任由警察副分局長兼任，業務受縣警察局指揮監督。

　　直到民國六十二年二月十二日，行政院公佈修正「戡亂時期臺灣地區戶政改進辦法」，規定戶政事務所隸屬縣警察局，取消鎮長兼任主任改由副分局長擔任，戶政人員列入警察機關編制，民國六十二年七月十七日修正公布戶籍法，正式成立彰化縣警察局北斗鎮戶政事務所，遷入北斗警察分局廳舍內辦公，座落於北斗鎮新政里光復路二五一號。

　　民國八十年五月一日宣佈終止動員戡亂時期後，戶警合一失去法源依據，籌劃歸屬民政機關事宜。民國八十一年六月二十九日修正公佈戶籍法，明訂縣政府設戶政事務所，以鄉鎮為管轄區域，民國八十一年七月一日起起正式隸屬縣政府，為彰化縣北斗鎮戶政事務所。民國八十一年十月四日戶政事務所新建辦公廳落成，當日遷入新址辦公，座落於北斗鎮新政里地政路466號，與北斗警察分局為鄰。